De Trombosedienst Leiden is nauw gelieerd met het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) en werkt nauw samen met apotheken,huisartsen en ziekenhuizen in de Leidse regio.

De Trombosedienst Leiden is een actief lid van de Federatie van Nederlandse Trombosediensten (FNT).

Sinds januari 2022 is Trombosedienst Leiden toegetreden als aspirant lid tot de CAT (Centrum Antistolling & Trombosezorg). Binnen deze constructie wordt actief samengewerkt op vele vlakken waaronder de gezamenlijke bereikbaarheidsdiensten.

In samenwerking met ASolutions Healthcare neemt Trombosedienst Leiden actief deel aan de ontwikkeling van  computersoftware voor de antistollingsbehandeling.